でかいプロジェクトをビルドするとメモリ不足になってました。FlexBuilder.iniに「-Xmx1024m」指定してもです。それより大きい値を指定すると、jreのエラーが発生してFlexBuilderが起動しません。 java6で「-Xincgc」を指定したら、メモリ不足は発生しなくな…